Spesifik moleküllerin yapısını tanımlamak için tanımlanabilecek belirli metabolik yollar vardır.
Sikimik asit yolu: öncüsü olarak sikimik asit içeren ikincil metabolik yol, kendisinden kaynaklanan ikincil metabolitlerde bulunabilen yapısal ve kimyasal özellikleri kendi içinde içeren bir molekül.
Sikimik asit molekülü şunlardan oluşur: 6 üyeli bir halka, 1 karboksilik grup ve 3 hidroksil grubu Aynı moleküler mimari, ondan kaynaklanan ve aslında türevleri olarak adlandırılan ikincil metabolitlerde bulunabilir. asit. bilimsel. Şikimik asit, iki farklı birincil metabolik yolun iki ara ürününün birleşmesinden kaynaklanır:
eritrosyum-4-fosfat (3C): fotosentezin karanlık fazının ara maddesi, anabolik metabolik süreç;
fosfoenolpiruvik asit (3C): glikoliz ara maddesi, katabolik metabolik süreç;
Bu nedenle, eritrosyum-4-fosfat + fosfoenolpiruvik asit = sikimik asit: ikincil metabolik yolların ilk öncüsü.
Hücre, ihtiyaçlar buna izin verecek kadar olduğunda veya iki ana ara ürünün miktarları çok fazla ve birikebilecek kadar olduğunda, hücre sikimik asidi sentezler; bu, hücrede yeterli miktarda ATP olduğunda ve bu, hücrede yeterli miktarda ATP olduğunda gerçekleşir. birincil katabolizma ve anabolizma reaksiyonlarını yavaşlatır.
Malonik ve mevalonik asit yolu: her iki öncül bir Asetil CoA molekülünden türemiştir, bu nedenle her ikisi de tek bir yolun altında yer alır: asetat yolu Asetil CoA, glikoliz ve Krebs döngüsü arasında bir bağlantı molekülüdür ve bu nedenle onu bir ara madde olarak tanımlayabiliriz. Hücrenin birincil metabolizması.
Asetat grubu (iki karbon atomlu grup) + CoA (koenzim A) = Asetil CoA: ikincil metabolitlerin yapımında biyolojik yapı taşı olarak kullanılan birincil metabolizmaya ait molekül.
Asetat yolu daha sonra malonik asit yolu ve mevalonik asit yolu ile ayırt edilir Koenzim A, iki karbonlu birimin sitoplazmadan Krebs döngüsünün gerçekleştiği hücrenin mitokondrisine taşınması görevi görür. enerji fazlalığı durumunda ve en çeşitli ikincil metabolitleri oluşturabilirler; bunlar, malonik asit (C4) ve mevalonik (C6) dahil olmak üzere ortak karakteristik olarak çift sayıda karbon atomuna sahiptir.
Sikimik asit ve asetatın metabolik yolları, bu nedenle, ikincil türevlerini kolayca tanımlamamızı sağlayan kesin bir moleküler mimariye sahiptir. İçin NS alkoloidler, farklı mimarilere sahip olan, öncünün tanımlanması o kadar kolay değil, diğer bir deyişle, alkaloitlerin tek kategorilerini sınıflandırmak, her birini tek bir öncüye kadar takip etmek o kadar kolay değil. öncül, çünkü amino asitlerden (hücrenin ikincil nitrojen molekülleri üretmek için kullandığı birincil nitrojen bileşikleri) türetilmiştir.İkincil nitrojen metabolitleri esas olarak alkaloidlerdir, ancak siyanojenik gibi kendilerinden daha düşük sağlık profiline sahip başka moleküller de vardır. glikozitler (acı bademlerde bulunur) ve β-siyanolar (pigmentler) Amino asitler birbirinden farklı azotlu bileşiklerdir ve bu çeşitlilik alkaloidler olan doğrudan türevlerinin çeşitliliğini yansıtır.
Farklı alkaloit kategorilerini birleştiren tek kimyasal element, heterosiklik bir halka içine alınmış bir nitrojen atomu veya en azından onlara temel özellikleri veren serbest elektron ikilisine sahip bir nitrojen atomudur; bireysel alkaloidleri çıkarmamızı sağlayan aynı temel reaktivite. yer değiştirme ile.
diyerek özetleyebiliriz. karbonhidrat yolu, tüm ikincil metabolitlerin sentezinin altında yatan metabolik yoldur., bu nedenle daha önce görülen tüm metabolik yolları içerir:
- asetat, glikoz molekülünün tamamen yok edilmesinin ürünüdür;
- amino asitler, karbonhidrat bozunmasının metabolik süreçlerinden elde edilir;
- sikimik asit, ikincil metabolitlerin ve aynı zamanda aromatik amino asitlerin (fenilalanin, triptofan ve tirozin) bir öncüsüdür;
- glikozit, şeker artı şeker olmayan bir birimden oluşan ve muhtemelen özetlenen metabolik yollardan birinden türeyen, aglikon adı verilen ikincil bir metabolittir.
Sekonder metabolitlerin kaynaklandığı tüm biyogenetik yapı taşları ya karbonhidratların katabolizmasından ya da anabolizmalarından kaynaklanır. Bu şekerler, bir zamanlar aglikona bağlanan glikozitleri oluşturan aynı şeker birimleridir.
Asetatın metabolik yolu, meydana getirdiği ikincil metabolitlerin tüm isimlerini içeren yoğun bir biyogenetik ağaca bölünmüştür.hücrenin kendisinin ihtiyaçlarına bağlı olarak farklıdır:
- ATP'nin nihai üretimi ile Krebs döngüsü (birincil metabolizma);
- β-oksidasyonu ve yağ asitlerinin sentezi (birincil metabolizma);
- İki asetat molekülünün birleşmesinden türetilen malonat veya malonik asit (4C) ve üç asetat molekülünün birleşmesinden türetilen mevalonat veya mevalonik asit (6C) sentezi. Hücre, eşit sayıda karbon atomuna sahip bu iki molekülü, hidrokarbon birimlerinin lineer zincirlerinden oluşan farklı moleküler kategoriler oluşturmak için kullanır, örneğin: yağ asitleri - sırayla gliseritler ve mumlar üretmek için kullanılır - terpenoidler, antrakinonlar ve steroidler.
"Biyogenez ve aktif bileşenlerin özellikleri" ile ilgili diğer makaleler
- Bir bitkinin birincil metabolizması ve ikincil metabolizması
- farmakognozi
- Sikimik asidin metabolik yolu